V současnosti začíná Zlatá stoka svůj tok na 116,9 říčním kilometru Lužnice na rozvodí nad jezem Pilař, který je výškově stavitelný, čímž lze ovlivnit množství vody vtékající do Zlaté stoky. Na úvodním snímku je Lužnice nahoře a vlevo, zatímco Zlatá stoka vpravo. Situace v terénu vypadá tak, že Zlatá stoka se odchyluje od Lužnice směrem na severozápad.
Původně však tok Zlaté stoky začínal až o čtyři kilometry níže po proudu, a to především v zájmu zajištění většího spádu.
jez smrti.
Po svém osamostatnění protéká Zlatá stoka západně od rybníka Pavelců, který je ovšem napájen z druhé strany Lužnicí, do níž také odvádí své vody. U rybníka zároveň dosahuje i jihovýchodního okraje obce Majdalena. Pod rybníkem u silnice z Majdaleny na Chlum u Třeboně nalezneme na pravém břehu penzion a restauraci U Pilaře.
Vzápětí stoka podtéká silnicí na Majdalenu, za níž se stáčí k západu a zahradami protéká hlouběji do obce obce, přičemž její tok z povzdálí kopíruje silnici.
Při zpracování této stránky byly použity následující podklady:
Monika Kopecká, 2.C